La segunda jornada de entrenamientos del Gran Premio de China quedó condicionada por una nueva avería en el motor de la Aprilia de Efrén Vázquez. En esta ocasión, el vizcaino vio como la moto se gripaba en la sesión libre, provocando además su caída y no pudo mejorar sus registros, lo que relegó hasta la 20ª plaza (2'14»561) de la parrilla de salida de 125 c.c. En la categoría reina, Colin Edwards (Yamaha YZR M 1) batió el récord del circuito y logró su primera mejor clasificación de la temporada, por delante de Valentino Rossi (Yamaha YZR M 1) y del australiano Casey Stoner (Ducati Desmosedici).