En la misa celebrada en Arantzazu con motivo de la festividad de la patrona de Gipuzkoa, José Ignacio Munilla hizo referencia a «la polémica suscitada en torno a la excarcelación de los presos de la organización terrorista ETA aquejados de enfermedades graves o incurables». El obispo de Donostia dijo que quienes utilizan este «principio humanitario» como «instrumento de reivindicación política sin condenar los atentados (...) humillan a las víctimas», al tiempo que pidió «no dejarse atrapar por la espiral de odio que genera el terrorismo».